Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nlrp9bQ66X22 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms