Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Hist2h2beQ64524 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Hist2h2beQ64524 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms