Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctr9Q62018 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms