Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itga6Q61739 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms