Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PcolceQ61398 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PcolceQ61398 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PcolceQ61398 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PcolceQ61398 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PcolceQ61398 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PcolceQ61398 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PcolceQ61398 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PcolceQ61398 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PcolceQ61398 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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PcolceQ61398 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
PcolceQ61398 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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