Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tbc1d1Q60949 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tbc1d1Q60949 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms