Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Akap4Q60662 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Akap4Q60662 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Akap4Q60662 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Akap4Q60662 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Akap4Q60662 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Akap4Q60662 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Akap4Q60662 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Akap4Q60662 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Akap4Q60662 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms