Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sin3aQ60520 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sin3aQ60520 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms