Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vmn1r223Q5SSA0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms