Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Phf12Q5SPL2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms