Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim41Q5NCC3 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms