Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Trp53i11Q4QQM4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trp53i11Q4QQM4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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