Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Lrrc43Q3V0L5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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Lrrc43Q3V0L5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Lrrc43Q3V0L5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Lrrc43Q3V0L5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Lrrc43Q3V0L5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Lrrc43Q3V0L5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Lrrc43Q3V0L5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Lrrc43Q3V0L5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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