Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prdm6Q3UZD5 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prdm6Q3UZD5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prdm6Q3UZD5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prdm6Q3UZD5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prdm6Q3UZD5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prdm6Q3UZD5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prdm6Q3UZD5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prdm6Q3UZD5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prdm6Q3UZD5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Prdm6Q3UZD5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Prdm6Q3UZD5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Prdm6Q3UZD5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Prdm6Q3UZD5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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