Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pfdn4Q3UWL8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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