Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm6899Q3USS0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm6899Q3USS0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms