Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp30Q3UN04 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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