Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxosQ3UL53 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms