Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
E330014E10RikQ3UL33 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
E330014E10RikQ3UL33 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms