Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sf3b2Q3UJB0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms