Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms