Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ctdnep1Q3TP92 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdnep1Q3TP92 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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