Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc10Q3TLI0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc10Q3TLI0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms