Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cpne9Q1RLL3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cpne9Q1RLL3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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