Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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ptchd1Q14B62 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ptchd1Q14B62 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ptchd1Q14B62 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ptchd1Q14B62 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ptchd1Q14B62 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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ptchd1Q14B62 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ptchd1Q14B62 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms