Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cnn1Q08091 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cnn1Q08091 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnn1Q08091 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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