Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
NrepQ07475 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms