Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Apoc2Q05020 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoc2Q05020 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms