Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msx2Q03358 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msx2Q03358 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Msx2Q03358 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msx2Q03358 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msx2Q03358 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Msx2Q03358 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msx2Q03358 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msx2Q03358 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msx2Q03358 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Msx2Q03358 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Msx2Q03358 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms