Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EgfrQ01279 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms