Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PrcdQ00LT2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms