Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Apoa1Q00623 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Apoa1Q00623 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms