Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tubg1P83887 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms