Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx3P81067 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms