Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Usp9xP70398 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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