Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ufm1P61961 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ufm1P61961 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ufm1P61961 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ufm1P61961 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ufm1P61961 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ufm1P61961 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ufm1P61961 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ufm1P61961 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ufm1P61961 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ufm1P61961 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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