Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csrnp3P59055 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms