Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tpm2P58774 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms