Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Dpf3P58269 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Dpf3P58269 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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