Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samsn1P57725 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms