Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NcstnP57716 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcstnP57716 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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