Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp5P56399 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp5P56399 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp5P56399 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms