Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Defb1P56386 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms