Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms