Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Aqp4P55088 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms