Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lbx1P52955 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lbx1P52955 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lbx1P52955 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Lbx1P52955 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Lbx1P52955 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Lbx1P52955 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lbx1P52955 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lbx1P52955 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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