Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ube2e3P52483 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms