Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CcnfP51944 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CcnfP51944 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CcnfP51944 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CcnfP51944 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CcnfP51944 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CcnfP51944 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CcnfP51944 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms