Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gli1P47806 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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