Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ItgavP43406 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
ItgavP43406 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ItgavP43406 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms